Уральский филиал ГЦСИ появился в Екатеринбурге в 1999 году и стал первой институцией в городе, работающей с современным искусством. В 2005-2011 годах филиал издавал журнал ZAART, ставший архивом уральского искусства 2000-х годов. В это же время сотрудниками Уральского ГЦСИ была сформирована обширная коллекция видеоарта Урало-Сибирского региона.

С 2008 года филиал запустил программу «Уральские заводы: индустрия смыслов», основной идей которой стало художественное переосмысление заводов и промышленной реальности в городской среде. Из этого исследования вырос один и самых масштабных проектов российской арт-системы – Уральская индустриальная биеннале современного искусства.  

С 2011 года филиал на собственной площадке проводит выставки, реализует образовательные программы, а также работает с локальным художественным сообществом через выставки, портфолио-ревю, воркшопы и резиденции, организованные филиалом. В 2018 году на базе ГЦСИ появился новый проект – «Лаборатория молодого художника». 

Сегодня более десяти проектов Уральского филиала стали номинантами всероссийской премии «Инновация».

Уральская индустриальная биеннале – крупнейший международный проект в сфере современного искусства на территории России. Уже десять лет предметом исследования биеннале является индустриальность, которая рассматривается как культурный феномен прошлого и настоящего Уральского региона. За это время в выставке приняли участие более 300 художников из 52 стран, а площадками проекта стали 14 заводов.

С 2020 года организаторами биеннале являются Государственный музей изобразительных искусств имени А.С. Пушкина, Уральский филиал Пушкинского музея (ГЦСИ Екатеринбург) и Центр поддержки и развития современного искусства ZA ART.

Уральская биеннале входит в Международную ассоциацию биеннале (The International Biennial Association) и проводится при поддержке Министерства культуры РФ.

«Лаборатория молодого художника» – это образовательный проект, реализуемый совместно с ведущими культурными институциями Екатеринбурга. Работа лаборатории направлена на поддержку молодых художников и создание условий для качественного обмена опытом внутри художественного сообщества. Первая лаборатория молодого художника была открыта в 2018 году на базе Уральского филиала ГЦСИ и стала номинантом премии «Инновация». Программа лаборатории включает тематические курсы, состоящие из лекционных и практических занятий на базе институций-партнеров. Лекторы и мастера лаборатории – кураторы, художники, галеристы.