Открытие здания Отдела состоялось 24 января 1994 года по адресу Волхонка, 14. В 2005 году Отдел личных коллекций переехал в новый отреставрированный комплекс по Волхонке, 10. Торжественное открытие отдела в новых стенах состоялось 9 июня 2005 года. К своему 20-летнему юбилею, в феврале 2014 года Отдел личных коллекций открыл для посетителей еще одно здание по адресу ул. Волхонка, 8, соединенное с предыдущим зданием Отдела, таким образом, расширив экспозиционную площадь.

С момента основания в фонды поступило от дарителей более 30 коллекций и творческих наследий художников. Коллекции отличаются друг от друга своей направленностью и структурой и делятся по видам искусства: живопись, графика, скульптура, декоративно-прикладное искусство и фотография. Среди них присутствуют монографические и тематические собрания, т.е. коллекции одного или нескольких видов искусства, объединенных временем создания. Характер каждой коллекции определяется вкусами и интересами в сфере искусства каждого из владельцев.

В настоящее время музейное собрание насчитывает более восьми тысяч единиц хранения произведений русского и западноевропейского искусства XV–XX веков. Это – живопись, графика, скульптура, декоративно-прикладное искусство и художественная фотография.

За годы существования в ГМИИ Отдела личных коллекций музей не только приобрел большое число новых памятников, но и связал себя крепкими узами дружбы и единомыслия с удивительными людьми, посвятившими себя благородному делу поиска и сохранения произведений искусства – коллекционерами.

Одной из важных форм деятельности музея является организация временных выставок. Все открываемые в музее выставки осуществляются благодаря тесным творческим связям сотрудников музея с московскими коллекционерами и наследниками художников.